公車路線：
乘坐大臺南市公車藍幹線、橘幹線或棕幹線至佳里，再轉乘藍1、藍10即可到達將軍區衛生所。
自行開車：
國道一號下麻豆交流道往西至佳里區走南19線往漚汪方向可到達將軍區衛生所。 或由西濱公路到達將軍區路段往西甲方向至漚汪。
本所位置交通示意圖